DISTRIBUSI KERAGAMAN GENETIK POPULASI Santalum album BERDASARKAN PENANDA RAPD

Anto Rimbawanto, AYPBC Widyatmoko, Purnamila Sulistyowati

Sari


Santalum album atau yang dikenal dengan nama cendana merupakan jenis kayu bemilai  tinggi dan telah mengalami degradasi sumber genetik yang serius. Jenis ini merupakan tanaman asli Propinsi Nusa Tenggara Timur. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman  genetik dan hubungan kekerabatan  populasi Santalum  album untuk mendukung  program konservasi dan pemuliaan jenis tersebut. Sampel daun dikumpulkan dari 17 populasi dan dianalisa menggunakan 17 primer RAPD yang menghasilkan 34 lokus polimorfik. Rata-rata lokus polimorfik per primer adalah 2. Nilai rata- rata keragaman genetik dalam populasi sebesar 0,391 sedangkan keragaman  antara populasi 0,038. Analisis klaster membagi 17 populasi menjadi dua kelompok besar. Secara umum pembagian kelompok tidak memperlihatkan hubungannya denganjarak geografis, tetapi populasi-populasi yang berdekatan mempunyai kecenderungan untuk membentuk satu  sub-kelompok.


Kata Kunci


Keragaman genetik; konservasi; RAPD; Santalum album

Teks Lengkap:

PDF

Referensi


Hamrick, J. L. 1989. Isozyme and the analysis of genetic structure in plant population. In Isozyme in Plant Biology. Soltis, D.E.and P.S. Soltis (ed). Dioscorides Press, Oregon, pp 87-105.

Hamrick, J.L. and M.J.W. Godt. 1989. Allozyme diversity in plants. In Plants Population Genetics Breeding and Genetic Resources. A.H.D. Brown, M.T. Clegg, A.L. Kahler, and B.S. Weir (eds.). Sinauer. Sunderland. Massachusetts. pp.43-63.

Lande, R. C. and Shannon, S. 1996. The role of genetic variation in adaptation and population persistence in a changing environment. Evolution 50:434-437.

Lee, S-L., Kevin, K.S., and Saw, L-G. 2002. Population genetic of Intsia palembanica (Leguminosae) and genetic conservation of virgin jungle reserves in Peninsular Malaysia. Am. J. Bot. 89:447-459.

Murray, M.G. and Thompson, W.F. 1980. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. Nuc. Acids. Res. 8. (19) : 4321-4325.

Nei M. 1972. Genetic distance between populations. American Naturalist 106: 283-292.

Nei, M. 1973. Analysis of gene diversity in-subdivided populations. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 70:3321-3323.

Nei, M. (1978). Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics 89: 583-590.

Rimbawanto, A. dan Suharyanto. 2005. Keragaman genetik populasi Shorea leprosula Miq. dan implifikasinya untuk program konservasi genetik. Prosiding Seminar Nasional Peningkatan Produktivitas Hutan-Peran Konservasi Sumber Daya Genetik, Pemuliaan dan Silvikultur dalam Mendukung Rehabilitasi Hutan. E.B. Hardiyanto (ed.). Fakultas Kehutanan UGM dan ITIO.Yogyakarta. pp. 373-382.

Shashidhara, G., Hema, M.V., Ranjan, M.P. and Farooqi, A. A. 2003. RAPD analysis of genetic diversity in Santa/um album. Plant & Animal Genomes XI Conference, San Diego, CA.

Shiraishi, S and Watanabe, A. 1995. Identification of chloroplast genome between Pinus densiflora SIEB et ZUCC and P. thunbergii PARL. based on the polymorphisms in rbcL gene.J. Jpn. For. Soc. 77:429-436.

Suma, T. B. and Balasundaran, M. 2003. Isozyme variation in five provenances if Santalum album in India. Australian Journal of Botany 51:243-249.

Welsh, J. and McClelland, M. 1990. Fingerprinting genome using PCR with arbitrary primers. Nucleic Acid Research 18:7213-7218.

Williams, J.G.K.,Kubelic, A.R., Livak, J. K., Ravalski, J. A.and Tingey, S. V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primer are useful as genetic marker. Nuc. Acid. Res. (18): 6531-6539p.

Yeh, F.C, Yang, R.C., Boyle, T.B.J., Ye, Z.H. and Mao, J.X. 1999. POPGENE 1.32 The User Friendly Shareware for Population Genetic Analysis. Molecular Biology and Biotechnology Center,University of Alberta, Edmonton.




DOI: https://doi.org/10.20886/jpht.2006.3.3.175-181

##submission.copyrightStatement##

JURNAL PENELITIAN HUTAN TANAMAN INDEXED BY:

More...

Copyright of Jurnal Penelitian Hutan Tanaman (JPHT)

eISSN : 2442-8930 pISSN : 1829-6327

JPHT is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.